دانشکده پزشکی دانشگاه شاهد از سال ۱۳۷۱ با هدف تربیت پزشک عمومی برابر مجوز وزارت بهداشت درمان وآموزش پزشکی با پذیرش ۴۸ دانشجو فعالیت خود را آغاز نمود. در حال حاضر 450 دانشجوی پزشکی در مقاطع علوم پایه و بالینی و64 دانشجو دردوره تحصیلات تکمیلی دررشتههای کارشناسی ارشد اقتصاد بهداشت، میکروب شناسی، فیزیولوژی، بیوتکنولوژی پزشکی و ایمونولوژی 8 دانشجو در دکترای تخصصی باکتری شناسی پزشکی به تحصیل اشتغال دارند.
75هیات علمی دانشکده در13 گروه آموزشی مسئولیت آموزش و پژوهش دانشجویان را برعهده دارند.
تاکنون 893 دانشـجو در مقـطع دکترای حرفه ای پزشکی و 200 دانشجو در مقطع کارشناسی ارشد و 12 دانشجو در رشته دکترای تخصصی باکتری شناسی از دانشکده پزشکی دانش آموخته
شده اند.
